เครื่องวิเคราะห์โปรตีนจำเพาะแบบอัตโนมัติส่วนใหญ่จะใช้เพื่อตรวจหารายการโปรตีนที่รออยู่ของ CRP, procalcitonin (PCT), Cystatin C (Cys-C) และ D-dimer ซึ่งการตรวจหาโปรตีนในพลาสมามีความสำคัญทางคลินิกอย่างมาก ในการวินิจฉัยโรคเรื้อรังบางชนิด การตรวจหาโปรตีนในพลาสมายังคงเป็นดัชนีการวินิจฉัยที่เร็วที่สุด เช่น โรคไตเรื้อรัง เบาหวาน โรคไขข้อ เป็นต้น
ในช่วงแรก ๆ ของเครื่องวิเคราะห์โปรตีนจำเพาะแบบอัตโนมัติ วิธีการตรวจหาแบบดั้งเดิมนั้นรวมถึงเชิงคุณภาพและกึ่งเชิงปริมาณ ในหมู่พวกเขาวิธีการเกาะติดกันเป็นเชิงคุณภาพ มีโอกาสเกิดผลบวกลวงได้มากมาย และโรงพยาบาลหลายแห่งก็กำจัดมันออกไปแล้ว โรงพยาบาลบางแห่งใช้เครื่องมือทางชีวเคมีในการวัดตัวบ่งชี้โปรตีน แต่เนื่องจากข้อจำกัดของวิธีการ เครื่องมือทางชีวเคมีจึงสามารถตรวจจับโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลมากเท่านั้น เช่น อิมมูโนโกลบูลินและอัลบูมิน สิ่งที่เราจำเป็นต้องรู้ในทางคลินิกคือปริมาณโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลที่แม่นยำถึง ng / ml หรือ pg / ml เครื่องมือวัดโปรตีนเฉพาะระดับมืออาชีพใช้การวัดความขุ่นของภูมิคุ้มกันแบบกระเจิง